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用细胞系外显子组测序研究肾细胞癌

更新时间:2017-09-07点击次数:275

细胞系在这项研究中,研究人员利用单细胞外显子组测序,发现CD133+RCC细胞有CSC特性,并可能来源于癌细胞,而不是正常肾细胞。KCP、LOC440040和LOC440563突变是新的肾肿瘤干细胞驱动基因。LOC440563编码一个RNA结合蛋白,其属于不均一核糖核蛋白(hnRNPs)。它影响前mRNA的加工、代谢和运输。LOC440563在结肠癌中是显著突变的;然而,这些基因突变不同于我们在RCC肿瘤干细胞中所确定的。考虑到hnRNP家族对DNA损伤修复的贡献,很可能LOC440563突变通过损害DNA修复过程而驱动CSC的多能性。
LOC440040是一个GRM5(谷氨酸受体、代谢型5)假基因。GRM5属于mGluR家族,失调的谷氨酸信号参与了许多类型的癌症,如神经胶质瘤、黑色素瘤。然而,LOC440040和癌症之间的关系目前还不清楚。确定突变体LOC440040是否影响RCCCSC群的谷氨酸能信号,将是十分必要的。
KCP编码一个分泌蛋白,它在TGF-β途径的调控作用中发挥复杂的作用。异常的KCP水平可能导致无数的肾脏病理与癌症。这项工作中所确定的KCP突变是否通过影响TGF-β信号而促进肿瘤干细胞的自我更新?十分有必要弄清这些问题。zui后,细胞系这项研究表明,KCP、LOC440040、LOC440563突变——目前存在于至少20%的参与调查的患者中,构成了强大而危险的驱动因子,促进肾细胞癌癌细胞重编程为CSCs。因此,它们可以作为RCC重要的预后因素和治疗靶点。
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细胞系

 

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