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原代细胞核心成分

更新时间:2018-01-30点击次数:339

原代细胞核接头蛋白LDB1是多蛋白转录复合体中的一个核心成分。Li等研究发现, 在小鼠胚胎和成体造血干细胞中LDB1起到关键作用。在造血干细胞和前体细胞中敲除该基因会造成一些维持多能性相关基因的转录下调, ChIP-Seq结果显示, LDB1形成的复合体结合在这些基因的启动子区域, 暗示 LDB1维持造血干细胞中起核心作用。

多能造血前体细胞是一种干细胞样细胞, 表达各种基因, 且有分化成包括免疫系统细胞在内的大量不同类型血细胞的能力。Zhang等利用ChIPSeq和RNA-seq技术在小鼠全基因组内找出造血前体细胞转化成定型T细胞中起作用的所有基因, 并确定了每个基因在发育过程中的转录时间点。同时, 还追踪了指引前体细胞到各种替代途径中的基因。结果不仅揭示了T细胞发育过程的时空调控网络, 也表明了T细胞发育过程如何关闭启动替代命运的基因。

少突胶质细胞(oligodendrocyte, OL)是中枢神经系统的髓鞘形成细胞, 原代细胞来源于其前体细胞。Olig2 是一种少突胶质细胞转录因子, 与前体细胞增殖和向少突胶质细胞分化密切相关。Yu等利用ChIPSeq进行全基因组分阶段研究发现Olig2充当了一种预定位(prepatterning)因子, 引导染色质重塑酶 Smarca4/Brg1到达少突胶质细胞活性靶点, 从而通过Brg1激活少突胶质细胞特定基因表达。Olig2和Brg1在染色质上的结合还指导重要的表观遗传修饰信息, 并预测重要的少突胶质细胞分化调控基因。
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原代细胞

 

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